Como resultado da destruição e degradação do habitat, tem-se verificado a perda de espécies e de comunidades vegetais e faunísticas espontâneas próprias destes tipos de habitats decorrentes da destruição irreversível destas áreas para outros usos. Como diversas espécies de flora e fauna (algumas prioritárias) tem a sua ocorrência restrita a estes habitats, o aumento de perturbação por factores humanos traduz-se em alterações na dinâmica populacional das mesmas, que poderá afectar a sua viabilidade a médio/longo prazo. Esta ameaça é potencial em toda a área do SIC da Costa Sudoeste.